В 2001 г. была создана Тувинская экспедиция Государственного Эрмитажа, в 2004 г. переименованная в Южно-Сибирскую в связи с расширением географии исследований.
Экспедиция работала двумя отрядами. Петроглифический отряд (С.В. Панкова) изучал памятники наскального искусства, связанные с таштыкской культурой Минусинской котловины (I–VII вв. н.э.). Эталоном для выделения особого таштыкского стиля в петроглифах стали резные изображения на деревянных плакетках, передающих сцены охоты и сражений. Серия таких плакеток представлена в коллекции Эрмитажа (Тепсей III, раскопки Красноярской экспедиции под руководством М.П. Грязнова 1967-68 гг.; на экспозиции в зале 31). Работы с петроглифами были завершены в 2004 г., а сама Южно-Сибирская экспедиция перешла под руководство К.В. Чугунова.
Второй отряд экспедиции (Н.Н. Николаев, С.В. Хаврин) осуществлял спасательные исследования на могильном поле Догээ-Баары вблизи г. Кызыла в Туве. Эти работы были продолжением исследований, ранее проводившиеся Центральноазиатской экспедицией НИИ Культурного и природного наследия под руководством К.В. Чугунова и прерванные в связи с началом раскопок кургана Аржан-2. Раскопки на Догээ-Баары проводились Эрмитажем с 2001 по 2008 г. (с 2004 г. уже в составе Центральноазиатской экспедиции под руководством Н.Н. Николаева).
Большая часть курганов, исследованных здесь до 2001 г., относились к V-IV вв. до н.э. Эрмитажные раскопки на могильнике Догээ-Баары II охватили в основном памятники завершающего этапа скифской культуры в Туве (III–I вв. до н.э.), а также средневековые погребения IX–X вв. Первые содержали изделия, характерные для хуннских памятников Забайкалья (керамика, костяные наконечники стрел), а также китайские импорты – фрагменты бронзовых зеркал, стеклянные бусы и остатки лаковых изделий. Вторые, представлявшие погребения по обряду сожжения, принадлежали енисейским кыргызам, пришедшим в Туву из Минусинской котловины после разгрома уйгуров в 840 г.
На территории могильника Догээ-Баары II исследовано поминальное сооружение кокэльской культуры (первая половина I тыс. новой эры) и несколько небольших безынвентарных каменных насыпей поминального характера.
Параллельно с раскопками экспедиция проводила обследование ближайших склонов гор Догээ и Сесерлиг. В результате было выявлено несколько каменных плоскостей с древними рисунками, выбитыми в разные эпохи от скифского времени до этнографической современности.
С.В.Панкова