В залах, посвященных скифской эпохе, центральное место занимают находки из Алтая и Тувы. Здесь представлены бытовая утварь, украшения, оружие и предметы конского снаряжения. Многие вещи позволяют говорить не только о высоком уровне развития ремесел, но и о хорошем художественном вкусе древних мастеров. Уникальны поделки из дерева, одежда и обувь из войлока, кожи и меха, происходящие из алтайских «замерзших» курганов, в которых прекрасно сохранились органические материалы. Эту часть экспозиции дополняют тувинские находки, среди которых заслуживают особого внимания комплексы самых ранних курганов скифского времени и реконструкции костюмов, позволяющие наглядно представить парадные одеяния людей, живших более двух с половиной тысяч лет тому назад. Особняком от алтайских и тувинских древностей стоят материалы тагарской культуры, занимавшей территорию Минусинской котловины в среднем течении Енисея. Куратор экспозиции – с.н.с., к.и.н. Н.Н.Николаев.